学界从很早就意识到农民工子弟学校可能存在的市场化运作倾向，不仅简单描述了农民工子弟学校的收支概况，同时也指出了在利益驱动下许多办学者进入农民工子弟教育市场的这一现象。开办农民工子弟学校，准入门槛低，投资少，虽然获取暴利的可能性很小，但是要实现有盈余的经营还是很容易的。有些学者还指出办学者将获得的利润并不投入学校办学环境的改善，并试图解释产生这一现象的原因。但是目前没有专门针对农民工子弟学校市场化运作这一主题的研究分析，学界关于这一主题的论述多散见于有关农民工子弟教育和农民工子弟学校的研究报告中，一提而过，并不作为主要的内容。另外，农民工子弟学校在取得办学资格，获得合法性之后依然没有改善教学条件的举动，这是上述研究所无法解释的。
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