1997年12月中国科学院向中央提交了《迎接知识经济时代，建设国家创新体系》的研究报告。1998年2月4日，江泽民做出重要批示：“我认为可以支持他们搞些试点，先走一步。真正搞出我们自己的创新体系。”1998年6月国务院正式批准中国科学院开展知识创新工程试点。实施知识创新工程试点以来，中国科学院在明确战略定位和办院方针、建立战略研究体系与机制，重构院宏观管理组织体系、改革人事管理制度与机制、改革资源配置和预算制度、改革科技评价和奖励制度、调整科技布局与组织机构、创新国内外开放合作模式等方面采取了一系列重大改革举措，探索建立了现代科研院所制度，改革创新发展成效显著，为科研事业单位改革提供了丰富的有借鉴意义的经验。
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