21世纪初，城乡教育统筹发展显得尤为必要。2001年，《关于基础教育改革与发展的决定》认为，改革开放以来，虽然我国的“两基”工作已经初步实现了目标，但是也出现了“发展不平衡，一些地方对基础教育重视不够”的弊端，据此提出了我国农村义务教育将实施“在国务院领导下，由地方政府负责、分级管理、以县为主”的管理体制，这标志着我国实行长达十余年的“以乡为主”农村义务教育管理体制的终结，同时也意味着我国城乡教育的对立关系开始解冻。2002年，党的十六大报告《全面建设小康社会，开创中国特色社会主义事业新局面》对于当时的形势有着清晰的认识：“现在达到的小康还是低水平的、不全面的、发展很不平衡的小康。”而这种不平衡则体现在诸多方面，其中“城乡二元经济结构还没有改变，地区差距扩大的趋势尚未扭转，贫困人口还为数不少”则被看成其中非常重要的一个因素。2003年10月，中共十六届三中全会提出了科学发展观，要求“坚持以人为本，树立全面、协调、可持续的发展观，促进经济社会和人的全面发展”。随后，《中共中央关于完善社会主义市场经济体制若干问题的决定》明确提出了“统筹城乡发展、统筹区域发展、统筹经济社会发展、统筹人与自然和谐发展、统筹国内发展和对外开放”五大统筹战略的发展理念，认为我国要改变城乡二元经济结构的体制，统筹城乡经济社会发展是关键。统筹城乡发展战略的提出对于城乡教育发展有着深刻的影响，教育作为社会系统中的一个子系统，与经济、文化、生态、政治等系统一起成为城乡统筹的内容。